Οι πτυχιούχοι του τμήματος δύνανται να εγγραφούν στο Γεωτεχνικό Επιμελητήριο Ελλάδας και να εργαστούν ως «γεωπόνοι». Για περισσότερες σχετικές πληροφορίες δείτε στα τμήματα «Γεωπονίας». Η Βιοτεχνολογία συνιστά έναν ραγδαία αναπτυσσόμενο σύνθετο επιστημονικό κλάδο, ο οποίος επιδιώκει την αξιοποίηση σύγχρονων τεχνικών και μεθόδων για την παραγωγή προϊόντων και υπηρεσιών υψηλής προστιθέμενης αξίας. Οι εφαρμογές της απαντούν, μεταξύ άλλων, στη σύγχρονη ιατρική και υγεία, στην αγροτική παραγωγή και ασφάλεια τροφίμων, στη βιομηχανία, στην προστασία του περιβάλλοντος και στην ενέργεια. Οι απόφοιτοι διαθέτουν εξειδικευμένες γνώσεις ώστε να συμμετέχουν στον σχεδιασμό, στην ανάπτυξη και εφαρμογή των μεθόδων της σύγχρονης βιοτεχνολογίας, να οργανώνουν και να λειτουργούν εργαστήρια παραγωγής και ελέγχου βιοτεχνολογικών προϊόντων, να εφαρμόζουν διαδικασίες βιοασφάλειας και βιοηθικής και να χειρίζονται βιολογικό, φαρμακευτικό και διαγνωστικό υλικό, συμπεριλαμβανομένων γενετικά τροποποιημένων οργανισμών. Παράλληλα, οι πτυχιούχοι του Τμήματος δύνανται να στελεχώσουν εργαστήρια έρευνας, ανάπτυξης και ποιοτικού ελέγχου σε εταιρείες πρωτογενούς παραγωγής και βιοπροϊόντων, φαρμακευτικές και βιοτεχνολογικές εταιρείες, σε νοσοκομεία και μικροβιολογικά εργαστήρια. Επιπλέον, δύνανται να στελεχώσουν εταιρείες εμπορίας προϊόντων βιοεπιστημών, εκπαιδευτικά και ερευνητικά ιδρύματα, καθώς και οργανισμούς και ελεγκτικές αρχές στην πιστοποίηση και ασφάλεια των βιολογικών διεργασιών και προϊόντων βιολογικής προέλευσης. Τέλος, οι πτυχιούχοι του Τμήματος εντάσσονται στον Κλάδο ΠΕ 88.01 Γεωπόνων και δύνανται να συμμετάσχουν σε διαγωνισμούς του Α.Σ.Ε.Π. για διδασκαλία συναφών μαθημάτων στη Δευτεροβάθμια Εκπαίδευση. Παράλληλα, εντάσσονται στο ΠΕ Γεωπόνων και δύνανται να εργαστούν σε φορείς του Δημοσίου.